L'ensemble du site Natura 2000 (territoires des Gorges du Cher ainsi que des côtes de Nerdre) abrite 13 habitats (milieux naturels) d'intérêt communautaire et inscrits à l'annexe 1 de la directive européenne de 1992.
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En cliquant sur le nom de l'habitat, vous serez réorienté sur le site de l'Inventaire National du Patrimoine Naturel qui consacre de nombreuses pages sur la description, la répartition et le statut de chaque habitat.
3150 - Plans d'eau eutrophes avec végétation enracinée avec ou sans feuilles flottantes
Petite mare à Potamot de 0,01 ha dans un prairie à Sainte-Thérence.
3260 - Rivières des étages planitiaire à montagnard avec végétation du Ranunculion fluitantis
Appelé également "rivières à renoncule", cet habitat se rencontre dans les parties rapides du Cher sur 5 zones bien identifiées de Prat à Lavault-Sainte-Anne pour un total d'environ 1ha.
4030 - Landes sèches européennes
Il s'agit de landes à bruyères (bruyère cendrée et callune). La plus belle zone est sur les côtes de Nerdres. Ces landes totalisent 7,5 ha sur le site.
5110 - Formations stables xéro-thermophiles à Buis des pentes rocheuses
Ces buxaies impénétrables totalisent 9,5 ha, principalement sur Lignerolles et Saint-Genest. On les rencontre également en mosaïque avec les pelouses et les falaises siliceuses à végétation chasmophytique.
5130 - Formation à genévrier commun sur landes ou pelouses calcaires
C'est un petit habitat en mosaïque avec des pelouses sèches sur 0,03 ha.
6210-36 - Pelouses calcicoles subatlantiques xériques et acidiclines
Ces pelouses sont présentes sur 5,8 ha dans des zones souvent escarpées entre agriculture et barres rocheuses.
Il s'agit d'une petite pelouse alluviale située sur une île en bas du château de l'Ours (0,4 ha).
Ces prairies de fauche ont deux aspects très différents.
- Un cortège avec orchidées, muscari et saxifrage au début du printemps.
- De grandes herbes avec la carotte sauvage, l'avoine élevée, la mauve, etc. avant la fauche tardive.
Ces prairies totalisent 32,5 ha sur le site.
6430 - Mégaphorbiaies hygrophiles
Il s'agit de formation herbeuses le long du Cher, notamment dans des zones de calme après le courant. Cet habitat est souvent présent sur de petites zones qui ne totalisent que 0,3 ha.
8220 - Pentes rocheuses siliceuses avec végétation chasmophytique
Ces barres rocheuses abritent une végétation particulière capable de pousser sur très peu de sol et de supporter d'importants écarts de température. L'asplénium, le nombril de vénus, l'épière droite et la jourbarbe sont les espèces les plus emblématiques. Etant donné les pentes importantes, la surface de cet habitat est très restreinte avec 1,70 ha au total.
91E0 - Forêt alluviale à Alnus glutinosa et Fraxinus excelsior
En aval des retenues, cet habitat s'étend le long des cours d'eau dès que les rives s'étales. Ce sont souvent des zones d'expansion lors des crues. Au total, cet habitat représente 27 ha sur le site.
9130 - Hêtraies de l'Asperulo-Fagetum
Assez peu fréquentes sur le site, ces forêts sont souvent un mélange entre chêne et hêtre dans des vallons souvent préservés. 3,3 ha ont été identifiés.
9180 - Forêts de pente, éboulis, ravins du Tilio-Acerion
Sous un couvert de grands arbres (tilleul, orme, frêne, érable, chêne, charme), cet habitat peut avoir deux facies très différents :
- Un sous-bois composé presque exclusivement de buis avec un relief très proncé avec de gros blocs rocheux.
- Un sous-bois plus clair avec la présence de l'asplenium scolopendre et des pentes plus douces et des éboulis rocheux au sol.
L'habitat prioritaire totalise 23,5 ha sur le site.
